針對韓國政府抗議日本內閣大臣參拜靖國神社，以及日本首相安倍晉三“絕不屈服外國壓力”的發言一事表示：“我們不希望靖國問題影響日韓兩國整體關系”。他表示，日本政府將會考慮發表一份符合21世紀政治的首相談話。

菅義偉在記者會見中強調：“對于那些為國捐軀的人表達尊崇之意是理所當然的。我們不希望靖國神社問題影響日韓兩國整體的關系。”

菅義偉說，對歷史問題，安倍內閣將遵從前首相村山富市發表的談話精神，認識也是相同的。但是日本政府會在合適的時期，發表一份符合21世紀政治面向未來的談話。

另據日本共同社報道，菅義偉在記者會上表示，日本將從大局出發，以對地區和平與繁榮負責的態度，繼續努力加強與韓國、中國的關系。關于歷史認識問題，菅義偉稱將維持日本政府的一貫立場，“虛心接受給亞洲各國造成巨大傷害這一事實，對此表示沉痛反省和衷心道歉”。